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在知识产权侵权纠纷案件中，最为重要的问题就是对行为人被控“侵权行为”的认定。但由于知识产权的特殊性,使得侵权证据极难获得或者即便取得却被认定为无效,无法作为定案的有效证据。就司法实践中在取证过程中应请注意的问题进行总结如下。一、取证方法1、自行取证和委托律师调查取证。因当事人较为了解自身权利及产品特点、技术特征及行业所涉及的范围，所以自行取证目标性较强。而律师调查取证则要比当事人调查取证更专业，收集证据的范围也更加广泛。因此建议两种基本方法应相互结合，相互补充。2、申请公证机关进行证据保全。《民事诉讼法》第五十九条规定：“人民法院对经过公证证明的法律行为、法律事实和文书，应当确认其效力。但是，有相反证据足以推翻公证证明的除外。”公证证据具有推定为真的效果。公证机关对证据进行保全的效果与法院依职权所进行的保全效果是相同的。因此，当事人如能在诉前充分运用公证机关收集、保全证据，应是一个做好诉前准备的有效措施。3、申请法院进行诉前证据保全及诉讼中申请法院调取证据。申请法院调取的证据通常分为三类：第一，保全被控侵权产品;第二，调查被控侵权单位的财务账册，以便确定赔偿额;第三，调取被控侵权人存在侵权的证据。法院通常采取的措施是对易拍照的被控侵权产品采用拍照的方式，或采用记录下被控侵权产品的技术特征的方式，对易于调取的书籍、商标实物等采用扣押、提取等手法，而对于被控侵权人的财务账册往往采取对财务办公室突然查封的方法，责令其交出帐册。4、申请行政机关调查取证。从事管理工作的部门在查处案件的过程中，可以根据需要依职权调查收集有关证据。可以查阅、复制与案件有关的合同、帐册等有关文件;询问当事人和证人;采用测量、拍照、摄像等方式进行现场勘验。